Godine 1933. osnovano je Veterinarsko odjeljenje pri  Higijenskom zavodu Split, pa se ta godina uzima kao početak veterinarske dijagnostike u Dalmaciji i osnivanje Veterinarskog zavoda Split. Rad Veterinarskog odjeljenja u ovom razdoblju obilježen je brojnim promjenama stručnjaka koji su večinom dolazili iz drugih sredina na rad u Split.

Veterinarsko odjeljenje se 1. srpnja 1945. osamostaljuje i postaje Zavod za veterinarsku epidemiologiju, a 1946. godine mijenja naziv u Veterinarska dijagnostička stanica Split. Sve to vrijeme Zavod radi u sklopu Higijenskog zavoda Split.

Od 1952. godine Veterinarska dijagnostička stanica Split preseljava u namjenski izgrađenu zgradu na adresi Poljička cesta 33 na kojoj se i dan danas nalazi.

Godine 1961. odlukom Izvršnog vijeća Republike Hrvatske, Sekretarijata za poljoprivredu,  tadašnje dijagnostičke stanice i veterinarski zavodi prenose se s državnog proračuna na samostalno financiranje uz ugovaranje poslova koje interesiraju Republiku, a Narodni odbori kotara postaju osnivači. Također se tom odlukom Veterinarska dijagnostička stanica preimenuje u Veterinarski zavod Split. Zavod postaje samostalna ustanova koja se samofinancira.

Veterinarski zavod Split se 1978. godine udružuje s Veterinarskim institutom Zagreb, Veterinarskim zavodom Križevci, Veterinarskim zavodom Rijeka i Veterinarskim zavodom Vinkovci i Središnjim zavodom za uzgoj i razmnožavanje u Zagrebu u Radnu organizaciju Veterinarski zavodi Hrvatske.

Godine 1995. osniva se Hrvatski veterinarski institut, Zagreb u čiji sastav ulaze Veterinarski zavod Vinkovci, Križevci, Rijeka, Split i Centar za peradarstvo. Podružnice više nemaju status pravne osobe,  na čelu Hrvatskog veterinarskog instituta je ravnatelj, a na čelu podružnica-zavoda predstojnik.

Veterinarski zavod Split je zadužen za područje četiri dalmatinske županije: Dubrovačko-neretvanske, Splitsko-dalmatinske, Šibensko-kninske i Zadarske. Tijekom svih ovih  godina Veterinarski zavod Split je aktivno sudjelovao u otkrivanju i suzbijanju zaraznih bolesti životinja i zoonoza kao što su boginje ovaca, bjesnoća, bruceloza, tuberkuloza, svinjska kuga, lišmanioza, bolest plavog jezika, leukoza goveda, nozemoza, varoza itd.

U proteklim godinama obavljao je svoju ulogu u zaštiti zdravlja ljudi i sigurnosti hrane animalnog porijekla na području četiri dalmatinske županije. Naročiti uspjeh Veterinarskog zavoda Split je imenovanje njegovih laboratorija kao referentnih laboratorija za bolest plavog jezika i bakteriološko i virološko onečišćenje školjkaša u Republici Hrvatskoj od strane Ministarstva poljoprivrede.

Veterinarski zavod Split je sudjelovao u više regionalnih projekata EU kao i projekta Ministarstva zdravstva Republike Italije.

Danas Veterinarski zavod Split je moderno opremljena institucija, uz obnovljenu i temeljito rekonstruiranu zgradu, zahvaljući sredstvima Svjetske banke i regionalnim projektima Europske unije.

U Veterinarskom zavodu Split trenutačno radi 24 djelatnika: 8 doktora veterinarske medicine te 3 diplomirana inženjera kemije i biotehnologije. Od toga je 4 doktora znanosti, (1  viši znanstveni suradnik, 1 znanstveni suradnik) i dva magistra. U zavodu je zaposleno 8 tehničara, 2 administrativne djelatnice i 3 spremačice. Rad Zavoda je organiziran u 5 jedinica i to:

Laboratorij za dijagnostiku (S-1)

Voditelj laboratorija: dr.sc. Damir Lukačević, dr. med. vet.

Tel: 021/371 582

Fax: 021/370 755

e-mail: Ova e-mail adresa je zaštićena od spam robota, nije vidljiva ako ste isključili JavaScript

Laboratorij za mikrobiologiju hrane i hrane za životinje (S-2)

Voditelj laboratorija: Tomislav Dujić, dr. med. vet.

Tel: 021/371 601

Fax: 021/370 755

e-mail: Ova e-mail adresa je zaštićena od spam robota, nije vidljiva ako ste isključili JavaScript

Laboratorij za analitičku kemiju i rezidue (S-3)

Voditeljica laboratorija: dr.sc. Tanja Bogdanović, dipl. ing.

Tel: 021/370 752

Fax: 021/370 755

e-mail: Ova e-mail adresa je zaštićena od spam robota, nije vidljiva ako ste isključili JavaScript

Laboratorij za pripremu podloga i sterilizaciju (S-4)

Voditeljica laboratorija: dr.sc. Irena Listeš, dr. med. vet.

Tel: 021/370 752

Fax: 021/370 755

e-mail: Ova e-mail adresa je zaštićena od spam robota, nije vidljiva ako ste isključili JavaScript

Opća jedinica (S-5)

Predstojnik: dr.sc. Eddy Listeš, dr. med. vet.

Tel: 021/370 752

Fax: 021/370 755

e-mail: Ova e-mail adresa je zaštićena od spam robota, nije vidljiva ako ste isključili JavaScript