Organizacija Instituta - Podružnice Podružnica Centar za peradarstvo · Laboratorij za analitiku stočne hrane· Laboratorij za bakteriologiju· Laboratorij za patologiju· Laboratorij za virusologiju i serologiju· Opća jedinica Podružnica Veterinarski zavod Križevci· Laboratorij za dijagnostiku· Laboratorij za mikrobiologiju hrane i hrane za životinje· Laboratorij za analitičku kemiju i rezidue· Laboratorij za hranjive podloge i sterilizacijuPodružnica Veterinarski zavod Rijeka· Laboratorij za dijagnostiku· Laboratorij za mikrobiologiju hrane i hrane za životinje· Laboratorij za analitičku kemiju i rezidue· Laboratorij za hranjive podloge i sterilizacijuPodružnica Veterinarski zavod Split · Laboratorij za dijagnostiku· Laboratorij za mikrobiologiju hrane i hrane za životinje· Laboratorij za analitičku kemiju i rezidue· Laboratorij za hranjive podloge i sterilizacijuPodružnica Veterinarski zavod Vinkovci· Laboratorij za dijagnostiku· Laboratorij za mikrobiologiju hrane i hrane za životinje· Laboratorij za analitičku kemiju i rezidue· Laboratorij za hranjive podloge i sterilizaciju